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Abstrait

Organisation de la chromatine et régulation transcriptionnelle au stade pachytène appauvri en TADs et en boucles au cours de la spermatogenèse

Zhengyu Luo, Xiaoyuan Song

Chez les mammifères, les structures de chromatine d'ordre élevé sont réorganisées au cours de la spermatogenèse. Les domaines d'association topologique (TAD) et les boucles de chromatine sont presque perdus au stade pachytène alors que le CTCF et la cohésion sont toujours liés à la chromatine pachytène, et les promoteurs et activateurs de la chromatine pachytène restent ouverts. Le fait que la chromatine pachytène soit activement transcrite lorsque les TAD et les boucles de chromatine sont perdues indique que la régulation transcriptionnelle des gènes au stade pachytène peut être indépendante des TAD et des boucles de chromatine. La perte des TAD et des boucles de chromatine est également observée dans les cellules dégradées de manière aiguë par le CTCF et la cohésion in vitro. Dans cette revue, nous discutons de l'organisation réorganisée de la chromatine au cours de la spermatogenèse, en particulier au stade pachytène. Nous discutons également des progrès récents dans notre compréhension des structures de chromatine à petite échelle au-delà des TAD et des boucles de chromatine et de leur relation avec la régulation transcriptionnelle dans les cellules normales et les cellules appauvries en CTCF ou en cohésion. Enfin, nous montrons que des découvertes récentes sur les structures de la chromatine au-delà des TADs et des boucles de chromatine peuvent expliquer la régulation transcriptionnelle des gènes au stade pachytène.