L'histopathologie (ou histologie) comprend l'examen de tissus entiers testés à la loupe. Trois types fondamentaux d'exemples sont obtenus par le centre de recherche en pathologie. Des exemples plus importants intègrent des organes entiers ou des parties de ceux-ci, qui sont expulsés lors d'opérations chirurgicales. Les illustrations incluent un utérus après une hystérectomie, le vaste intérieur après une colectomie ou des amygdales après une amygdalectomie.
Des morceaux de tissu au lieu d'organes entiers sont évacués sous forme de biopsies, qui nécessitent régulièrement des méthodes chirurgicales plus petites qui peuvent être effectuées alors que le patient est encore conscient mais calme. Les biopsies comprennent des biopsies par extraction, dans lesquelles le tissu est évacué avec une lame chirurgicale (par exemple, une extraction cutanée pour un grain de beauté suspect) ou une biopsie centrale, dans laquelle une aiguille est enfoncée dans une masse suspecte pour expulser un crawl ou un centre de tissu qui peut être analysés sous l'instrument grossissant (par exemple pour rechercher une bosse sur la poitrine).
Liquide et petits morceaux de tissu (cellules individuelles au lieu de rassemblements de cellules, par exemple à l'intérieur du liquide autour d'un poumon) peuvent être acquis au moyen d'une aspiration à l'aiguille fine (FNA). Ceci est réalisé en utilisant une aiguille plus fine que celle utilisée dans le cadre d'une biopsie centrale, mais avec une approche comparative. Ce type de matériel est normalement fluide par opposition à fort, et est soumis à la cytologie au lieu de l'histologie (voir Cytopathologie).