Journal de chimie clinique et de médecine de laboratoire

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Abstrait

Sélection de gènes candidats liés aux caractéristiques du muscle psoas chez les porcs Debao et Landrace sur la base d'une analyse du transcriptome

Chen-Yi Chang1 , Su-xian Zeng2 , Yuan-Ding Ma1 , Jun-Wen Zheng1 , Xin Li1 , Chen-Yong Xiong1 , Hong-Jin Zhou1 , Chun-Tao Wei1 , Zong-Qiang Li

Identifier les gènes importants qui affectent les différences phénotypiques entre les porcs Landrace et Debao, en particulier les différences de métabolisme et de croissance musculaire. Les gènes différentiellement exprimés du psoas majeur ont été détectés par séquençage du transcriptome d'ARNm chez les porcs Landrace et Debao. En extrayant l'ARN total du muscle psoas majeur du porc Landrace et du porc Debao, en purifiant l'ARNm, en construisant la bibliothèque d'ADNc, en effectuant le séquençage du transcriptome, puis en évaluant la qualité du séquençage, nous savons que la qualité du séquençage de cette étude est relativement élevée. Au total, 17 943 gènes ont été détectés dans tous les échantillons, dont 17 870 gènes connus et 73 nouveaux gènes. Les gènes définis avec |log2FC| supérieur à 2 et une valeur Q inférieure à 0,001, et les ont examinés comme des gènes significativement exprimés de manière différentielle. Français Au total, 1661 gènes différentiellement exprimés ont été examinés à partir d'échantillons de porcs Landrace et de porcs Debao, parmi lesquels 1255 gènes étaient différentiellement régulés à la hausse et 406 gènes étaient différentiellement régulés à la baisse. Grâce à l'analyse différentielle des gènes, il est conclu que ces gènes sont principalement impliqués dans la régulation métabolique, le développement des muscles et de la graisse et d'autres processus, en particulier certains gènes fonctionnels importants tels que MAPK14, FOS, SIRT1, KRAS, EGR1, CDNNB1, etc. Pour résumer, cette étude a utilisé la méthode de séquençage du transcriptome, puis a sélectionné les gènes différentiellement exprimés entre les porcs Landrace et les porcs Debao grâce à l'analyse des données, et a finalement éliminé les gènes importants affectant les différences phénotypiques, ce qui a fourni un support génétique pour la sélection de meilleures races à l'avenir.

Clause de non-responsabilité: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été révisé ou vérifié.
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