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ToxDelta : un nouveau programme pour évaluer l'impact de la dissimilarité sur l'effet des substances chimiques

Azadi Golbamaki, Alessio M Franchi, Serena Manganelli, Alberto Manganaro, Giuseppina Gini et Emilio Benfenati

ToxDelta est un nouvel outil d'évaluation de la toxicité des produits chimiques basé sur une version modifiée du package fmcs_R. Deux molécules structurellement similaires partagent une sous-structure commune maximale (MCS). Afin d'évaluer si deux molécules similaires ont des effets différents, nous avons concentré notre attention sur les fragments moléculaires qui ne sont pas dans la MCS. Ces parties peuvent augmenter ou diminuer la valeur de la propriété. Nous avons envisagé une variante du concept MCS de pertinence efficace dans l'évaluation de la toxicité où les anneaux de molécules ne doivent pas être brisés. Pour évaluer la toxicité du produit chimique cible, ToxDelta extrait la MCS et délimite les fragments restants. Chacune de ces fractions représente une différence entre deux molécules et sa pertinence dans l'évaluation de la toxicité est évaluée par rapport à une liste de fragments actifs et inactifs basée sur la connaissance. ToxDelta considère les dissimilarités des molécules dans une approche de lecture croisée.