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Abstrait

Prédictions quantitatives sensibles des peptides de liaison au CMH et des vaccins peptidiques à base de fragments de Trichinella spiralis

Gomase VS et Chitlange NR

Trichinella spiralis est un parasite nématode, présent chez les rats, les porcs, les ours et les humains, et est responsable de la trichinose. Des fragments peptidiques de la protéine antigénique peuvent être utilisés pour sélectionner des nonamères à utiliser dans la conception rationnelle de vaccins et pour améliorer la compréhension des rôles du système immunitaire dans les maladies infectieuses. L'analyse montre que les peptides de liaison MHC de classe II de la protéine antigénique de Trichinella spiralis sont un déterminant important pour la protection de l'hôte contre l'infection parasitaire. Dans cet essai, nous avons utilisé les algorithmes PSSM et SVM pour la conception de l'antigène et avons prédit l'affinité de liaison de la protéine antigénique ayant 439 acides aminés, qui montre 432 nonamères. La prédiction de la capacité de liaison des peptides antigéniques aux molécules du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) de classe I et II est importante dans le développement de vaccins à partir de Trichinella spiralis.