Journal des antiviraux et des antirétroviraux
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Abstrait

Analyse phylogénétique du virus de la grippe porcine H1N1 isolé en Inde

Nutan Prakash, P. Devangi, K. Madhuuri, P. Khushbu et P. Deepali

Le sous-type H1N1 du virus de la grippe A est l'agent causal de la grippe porcine. L'épidémie de 2009 causée par le sous-type H1N1 chez l'homme est due au transfert du virus de la grippe porcine du porc à l'homme. Ainsi, pour analyser l'origine de ce nouveau virus, nous avons comparé les 42 séquences de nucléocapside de virus H1N1 d'origines différentes. Une analyse phylogénétique de ces séquences a été réalisée avec une analyse bootstrap de 100 réplicats. L'arbre phylogénétique construit a révélé que la souche indienne H1N1 présentait la plus forte homologie avec la souche H1N1 de l'Iowa et également avec la souche H1N1 du Wisconsin. De plus, les souches H1N1 analysées à l'aide de séquences NP de différentes origines indiennes présentaient une similarité de séquence très étroite. Par conséquent, à l'avenir, cette étude sera utile pour connaître la taxonomie et l'évolution des virus de la grippe.