ISSN: 2169-0138
Youri N. Vorobjev
La conception d'un composé médicamenteux capable de se lier efficacement à la surface interne du canal E et de bloquer la diffusion des ions H + /K + à travers le canal et d'inhiber la réplication du virus est une tâche importante. Un ensemble de candidats médicaments, dérivés d'un composé principal (diazabicyclooctane), a été proposé très tôt et son interaction avec les structures natives et mutantes de la protéine E est étudiée via des simulations MD et des simulations de position/énergie de liaison. Il est démontré que la protéine E possède des sites de liaison dans le canal et hors canal de haute affinité pour un ensemble de bloqueurs moléculaires. Les mutants les plus probables des acides aminés du canal E sont considérés et l'efficacité de la liaison dans le canal des molécules bloquantes est analysée.