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Abstrait

Informations sur l'accessibilité de surface des fragments peptidiques de la protéine de coque du virus de la mosaïque de la luzerne (AMV) aux niveaux physicochimique et immunochimique

Gomase VS et Kale KV

Le virus de la mosaïque de la luzerne (AMV) infecte plus de 600 espèces végétales appartenant à 70 familles (hôtes expérimentaux et naturels). Les protéines d'enveloppe sont des matériaux importants pour établir des corrélations structure-fonction avec des peptides biologiquement actifs aux niveaux physicochimique et immunochimique et sont également de bons modèles pour observer les changements évolutifs dans les molécules protéiques. Les peptides antigéniques en position 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21 ; 151-PTHAGMQNQNF-161 ; 22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44 de la protéine d'enveloppe du virus de la mosaïque de la luzerne sont les plus adaptés au développement de vaccins sous-unitaires car avec un seul épitope, la réponse immunitaire peut être générée dans une grande population. Dans cette recherche, nous avons utilisé les algorithmes PSSM et SVM pour la prédiction du peptide de liaison du CMH de classe I et II, de l'antigénicité, de l'accessibilité aux solvants, des résidus polaires et non polaires pour analyser les régions susceptibles d'être exposées à la surface des protéines potentiellement antigéniques qui permettent aux cibles médicamenteuses potentielles d'identifier les sites actifs contre l'infection ainsi que de concevoir un vaccin peptidique synthétique.