Conception de médicaments : accès ouvert
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ISSN: 2169-0138
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Sherkhane AS et Gomase VS
La protéine neurotoxine longue 2 du venin de Naja naja présente une grande affinité envers les récepteurs de l'acétylcholine, ce qui produit une paralysie périphérique en bloquant la transmission neuromusculaire au niveau du site postsynaptique. Dans cette étude, nous utilisons une méthode TAPPred basée sur la cascade SVM qui a trouvé 26 régions peptidiques de transport TAP à haute affinité. TAP est une protéine transmembranaire hétérodimérique qui transporte les protéines peptidiques antigéniques vers le réticulum endoplasmique où elle se trouve aux molécules de classe I du CMH. Ces complexes CMH-peptide seront transloqués à la surface des cellules présentatrices d'antigènes (APC), où ils sont reconnus par les récepteurs des lymphocytes T pour déclencher une réponse immunitaire. Par conséquent, la prédiction des peptides de liaison au TAP est utile pour identifier les épitopes des lymphocytes T restreints à la classe I du CMH et donc utile pour la conception d'un vaccin peptidique synthétique.