Conception de médicaments : accès ouvert
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Abstrait

Études in silico pour la conception et le développement d'inhibiteurs contre la COVID-19

Akshata R. Pahelkar, Pritam V. Bagwe, Khushboo Maurya, Nikhil R. Pahelkar, Shreerang V. Joshi, Vikas N. Telvekar

Objectif : La pandémie de COVID-19 telle que déclarée par l'OMS, a signalé son premier cas à Wuhan, province de Hunei, en Chine. Les infections sont désormais généralisées et au 30 ^mars 2020, 6 93 224 cas d'infection et 33 106 décès ont été signalés dans le monde. Il s'agit d'une préoccupation internationale liée à la santé publique. Plusieurs études de recherche sont menées dans le monde entier au milieu de ces crises. Diverses hypothèses de traitement et de prévention concernant le développement de vaccins, la réutilisation de médicaments ainsi que le développement de nouvelles entités chimiques sont à l'étude. COVID-19 est un virus de la famille des coronavirus de virus du genre bêta. Il présente des similitudes avec le SARS-CoV qui a été signalé précédemment. Nous prévoyons de proposer un échafaudage pour la conception d'un inhibiteur spécifique dérivé de peptides contre COVID-19.

Méthodes : Notre stratégie consiste à concevoir un inhibiteur peptidique qui interagira avec le RBM du SARS-CoV-2 et inhibera son entrée à l'intérieur de la cellule. La conception assistée par ordinateur de médicaments est l'un des outils disponibles qui peuvent aider à atteindre la productivité en moins de temps. Nous avons utilisé une plateforme de conception de peptides en ligne appelée rosetta, Autodock Vena, un logiciel de conception de médicaments assistée par ordinateur (sous licence de M. Nikhil Pahelkar) et la Drug Discovery Suite de Schrodinger (sous licence de ICT, Mumbai).

Résultat : Nous proposons un peptide basé sur la séquence de l'ACE2 humaine qui interagit fortement avec le RBM du SARS-CoV-2. Les lecteurs intéressés peuvent utiliser la séquence pour modifier davantage la séquence peptidique afin de la convertir en peptidomimétique.