Conception de médicaments : accès ouvert
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Abstrait

Approche computationnelle pour la conception de médicaments basée sur la structure à partir d'une série de composés antiviraux naturels pour la famille Herpesviridae

Vipan Kumar Sohpal, Apurba Dey et Amarpal Singh

Le virus de l'herpès simplex provoque de multiples infections par le biais de matériel génétique et protéomique. Dans le scénario actuel, un antibiotique à large spectre est utilisé pour contrôler et réduire l'infection. Cet article se concentre sur le développement d'une conception de médicaments basée sur la structure pour l'infection par le HHV qui implique le choix des protéines cibles, la visualisation de la structure cible, l'identification du site de liaison, l'amarrage des ligands et l'évaluation de ceux-ci à l'aide de techniques informatiques. La modélisation d'homologie est effectuée pour la structure de la base de données protéique (PDb) de la glycoprotéine et de l'ADN polymérase du HHV-I et II. Sur la base de leur activité antivirale connue, vingt et une molécules naturelles sont sélectionnées pour le médicament proposé. Enfin, 15 molécules passent la règle de Lipinski de cinq pour la sélection des ligands et la meilleure d'entre elles basée sur l'efficacité du ligand, l'affinité de liaison et la constante inhibitrice est proposée pour la cible du médicament.