Transcriptomique : libre accès
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Abstrait

Un surdosage de vitamine B2 induit des réponses bénéfiques du transcriptome de l'intestin postérieur chez les porcelets sevrés

Jérôme Schmeisser*1, Britt Blokker1, Christelle Iaconis1, Stéphane Etheve2 et Estefania Perez Calvo1

Des niveaux alimentaires élevés de vitamine B2 sur le transcriptome caecal des porcelets sevrés ont été étudiés, afin d'évaluer si un surdosage de riboflavine pouvait atteindre l'intestin postérieur et par conséquent déclencher une réponse bénéfique de l'hôte. L'expression des gènes caecaux a été évaluée à l'aide d'une puce à ADN transcriptome Agilent, 14 et 28 jours après la supplémentation dans trois groupes expérimentaux ; un groupe témoin (dose recommandée de riboflavine : 10 mg/kg d'alimentation) et deux groupes supplémentés en plus pour atteindre respectivement 50 ou 100 mg/kg de riboflavine. Les deux niveaux de supplémentation ont significativement modifié le profil du transcriptome caecal par rapport au témoin. La dose de 100 mg/kg a entraîné le plus grand nombre de gènes différentiellement exprimés. Au jour 14, les gènes les plus modulés étaient liés au stress oxydatif et à la réponse immunitaire, confirmant l'effet antioxydant de la riboflavine. Français De plus, les voies impliquées dans la réponse de l'hôte aux changements du microbiote ont été modulées, indiquant des effets modulateurs de la riboflavine sur le microbiome, et indirectement la réponse de l'hôte. Enfin, la dose la plus élevée de riboflavine a déclenché des mécanismes moléculaires impliqués dans le métabolisme de l'aldostérone et des acides biliaires, démontrant le potentiel de la vitamine B2 pour améliorer l'état de santé de l'intestin postérieur. Un impact plus faible de la supplémentation de 100 mg/kg de riboflavine sur l'expression des gènes cæcaux a été constaté au jour 28. Néanmoins, certaines réponses génétiques positives ont été montrées contre les dommages à l'ADN pour les deux niveaux de supplémentation, et certaines voies liées à la signalisation cellulaire ont été modulées. Les données présentées dans cette étude confirment que le surdosage de vitamine B2 affecte la physiologie cæcale, et des recherches plus approfondies sont nécessaires pour étayer les résultats de la modulation possible sur le microbiote et le métabolisme des acides biliaires. En conclusion, le surdosage de vitamine B2 a un impact positif sur la réponse transcriptomique du cæcum des porcelets sevrés. Cela crée l’opportunité d’envisager la riboflavine comme une nouvelle solution pour réduire l’incidence et la gravité des problèmes digestifs associés à la période suivant immédiatement le sevrage.

Mots clés : transcriptomique, microarray, porcelets, riboflavine, vitamine

DEG : gène différentiellement exprimé

PCA : Analyse en Composantes Principales

PCR : Réaction en chaîne par polymérase

UPLC : Chromatographie liquide ultra performante

ARN : Acide ribonucléotidique

LC/MS : Chromatographie liquide / Spectrométrie de masse

Ct : Seuil de cycle

RIN : Numéro d'intégrité de l'ARN

FDR : Taux de fausses découvertes

KEGG : Encyclopédie de Kyoto sur les gènes et les génomes

HSP : protéine de choc thermique

ROS : Espèces réactives de l'oxygène

BA : Acide biliaire