Journal des maladies infectieuses et de la médecine préventive
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Abstrait

Séquençage du génome entier pour la détection de la tuberculose zoonotique à Querétaro, au Mexique

Claudia Angelica Perea Razo, Feliciano Milian Suazo, Isabel Barcenas Reyes, Susana Sosa Gallegos, Elba Rodriguez Hernandez, Susana Flores Villalva et Germinal Jorge Canto Alarcon

Au total, 2 736 échantillons (expectorations, urines et autres liquides) ont été prélevés sur 1 154 patients suspects de tuberculose à Querétaro, au Mexique. Une coloration acido-résistante et une culture en milieu sélectif, Stonebrink et Lowenstein-Jensen, ont été réalisées sur tous les échantillons. Le génotypage des isolats a été réalisé par spoligotypage et séquençage du génome entier par polymorphisme mononucléotidique (SNP). Les spoligotypes et les types SNP de Mycobacterium bovis obtenus ont été comparés à ceux des bovins trouvés dans une base de données. Vingt-et-un isolats (1,8 %) de Mycobacterium ont été obtenus par culture, tous issus d'expectorations ; deux (13 %) ont été identifiés comme M. bovis par spoligotypage, SB0673 et SB0971, qui sont fréquemment trouvés chez les bovins au Mexique. Parmi les isolats, 15 ont été entièrement séquencés, confirmant que deux d'entre eux étaient des M. bovis . Les profils SNP des deux isolats de M. bovis d'origine humaine étaient similaires à ceux trouvés chez les bovins de différentes régions du Mexique.