Gynécologie & Obstétrique
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Abstrait

Utilisation du profilage d'ARNm sanguin pour identifier des biomarqueurs pour le dépistage du cancer de l'ovaire

Samuel C Mok, Jae-Hoon Kim, Steven J Skates, John O Schorge, Daniel W Cramer, Karen H Lu, Choong-Chin Liew

Objectif : Identifier les signatures génomiques candidates pour la détection précoce du cancer de l’ovaire en utilisant des profils d’expression génétique basés sur le sang total.

Conception expérimentale : Nous avons effectué des analyses de microarray Affymetrix U133Plus 2.0 GeneChip sur des échantillons d'ARN de sang total obtenus auprès de 14 patientes atteintes d'un cancer de l'ovaire et de 15 femmes en bonne santé du même âge. Les gènes exprimés différemment ont été identifiés à l'aide d'un test t de Welch paramétrique. Des analyses qRT-PCR en temps réel ont été réalisées sur l'ARN préparé auprès de 96 patientes atteintes d'un cancer de l'ovaire et de 83 femmes en bonne santé du même âge, à l'aide d'ensembles d'amorces spécifiques pour 14 gènes. Un test U de Mann Whitney a évalué la signification de chaque gène. Les niveaux de CA125 ont été déterminés dans le même ensemble d'échantillons. Nous avons utilisé des analyses de régression logistique et une validation croisée pour évaluer la capacité des combinaisons linéaires de transcrits spécifiques combinés à CA125 à distinguer le cancer des témoins.

Résultats : Les analyses de microarray ont montré que les profils d'expression des gènes sanguins des sondes 9583 étaient significativement différents chez les femmes en bonne santé par rapport à ceux des patientes atteintes d'un cancer de l'ovaire (p<0,05). Les analyses RT-PCR en temps réel sur les 96 cas et 83 témoins ont validé 7 gènes, qui présentaient des niveaux d'expression significativement différents chez les cas et les témoins. Les analyses de régression logistique et la validation croisée ont identifié un panel optimal de marqueurs, notamment CA125, BRCA1 et KIAA0562, qui pourraient améliorer la sensibilité du CA125 seul à plus de 90 % avec une spécificité de 98 % dans la détection du cancer de l'ovaire à un stade précoce.

Conclusion : Les profils d’expression génétique dans le sang circulant ont permis d’identifier des marqueurs d’ARN qui peuvent améliorer la sensibilité du CA125 dans la détection du cancer de l’ovaire à un stade précoce. Une validation plus poussée est nécessaire pour confirmer l’utilité clinique de ces biomarqueurs.