Journal de chimie physique et biophysique
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Abstrait

Résidus de tryptophane de la fente de liaison de la coiffe dans les membres de la famille eIF4E : leurs contributions aux spectres de dichroïsme circulaire dans le proche UV

Joanna Zuberek* et Agnieszka Stelmachowska

eIF4E, un facteur clé dans l'initiation de la traduction dépendante de la coiffe, se lie à la structure de la coiffe à l'extrémité 5' de l'ARNm par une interaction d'empilement impliquant deux de ses huit résidus de tryptophane conservés. Dans cet article, nous avons examiné les contributions individuelles des résidus de tryptophane aux spectres de dichroïsme circulaire proche UV pour identifier les similitudes et les différences structurelles dans le motif de liaison de la coiffe parmi les membres de la famille eIF4E. Le spectre CD proche UV de l'eIF4E1a humain sous sa forme apo, résultant principalement de la transition 1Lb et dominé par deux bandes vibrioniques, est conservé parmi les eIF4E. Sur la base de la comparaison des spectres CD des mutants eIF4E, nous avons montré que les tryptophanes impliqués dans l'interaction d'empilement donnent les contributions individuelles les plus fortes, ce qui permet d'identifier leur orientation différente par rapport à la coiffe. Cela indique que le CD proche UV est un outil rapide et puissant pour analyser la conformation du tryptophane dans les protéines eIF4E et leurs changements lors de la liaison d'analogues de coiffe modifiés.