ISSN: 1745-7580
Prashant Singh, Nitya G Chakraborty, Sidharth S Jha, Umar Farooq, Mei Xiao, Veneta Qendro, Arvind Chhabra, Richard Everson, David I Dorsky, Upendra P Hegde et Bijay Mukherji
La thérapie cellulaire adoptive (ACT) avec des populations élargies in vitro de lymphocytes T modifiés pour exprimer des récepteurs de lymphocytes T spécifiques d'épitopes tumoraux (TCR) fait actuellement l'objet d'essais cliniques pour diverses tumeurs malignes. Dans ce contexte, l'ACT avec l'épitope du mélanome, Mart-1(27-35), des lymphocytes T modifiés spécifiquement par TCR a montré des résultats encourageants dans le mélanome métastatique. Un certain nombre de processus biologiques régulant les fonctions des lymphocytes T se sont toutefois révélés être des obstacles à cette forme de thérapie contre le cancer. À ce titre, des efforts sont en cours pour acquérir une meilleure compréhension de la biologie (fonctionnalité et contraintes) des lymphocytes T modifiés par TCR (TCReng) afin d'extraire des effets thérapeutiques plus robustes de l'ACT. Les tests traditionnels basés sur les lymphocytes T sont cependant quelque peu inadéquats à cet effet. En utilisant des tests NGS (Next Generation RNASeq) et qRT-PCR, nous avons examiné le transcriptome des lymphocytes T humains TCReng spécifiques de l'épitope du mélanome, Mart-1(27-35). Nous avons constaté que les profils transcriptionnels des cellules T spécifiques TCReng (CD8+ et CD4+) de Mart-1(27-35) sont remarquablement similaires lorsqu'ils sont exposés au peptide apparenté. Les gènes responsables de l'activation des cellules T, de l'apoptose, de la prolifération cellulaire, de la réponse cytolytique et de la différenciation des cellules T ont montré des profils d'expression similaires. De plus, notre analyse a également révélé un certain nombre de variantes d'épissage alternatives et de nouvelles isoformes liées à la réponse immunitaire qui n'étaient auparavant pas associées à l'activation des cellules T, ainsi que l'expression d'un certain nombre d'ARN longs non codants (lncRNA) récemment découverts.