Journal de chimie physique et biophysique
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Abstrait

Effet des forces visqueuses et externes sur la dénaturation thermique du modèle Peyrard-Bishop

Hidayat W, Sulaiman A, Viridi S et Zen FP

L'effet de la viscosité et des forces externes sur la dénaturation thermique de l'ADN du modèle Peyrard-Bishop est étudié. Le calcul de la fonction de partition pour déterminer l'étirement des liaisons hydrogène a été effectué par Monte-Carlo intégral de chemin. Le résultat montre que l'interaction entre le potentiel visqueux et les forces externes empêche l'ADN de se décompresser parfaitement mais permet à l'ADN de se diviser à une certaine distance de sa position d'origine. L'augmentation du coefficient de viscosité réduira la température de fusion. Le résultat obtenu a également montré comment à une certaine température le potentiel externe donne une contribution dominante à la dénaturation, supérieure même à l'effet de la viscosité.