Journal des techniques de chromatographie et de séparation
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Abstrait

L'application de SIMCA P+ dans l'analyse métabolomique au fusil de chasse des spectres ZIC®HILIC-MS de l'urine humaine - Expérience avec le logiciel d'extraction de données Shimadzu IT-T et Profiling Solutions.

Drupad K Trivedi et Ray K Iles

La recherche de biomarqueurs de maladies est passée des métabolites aux protéines, puis aux gènes et vice versa, au fur et à mesure du développement de la technologie. Les scientifiques en bio-analyse ont été formés pendant des décennies pour isoler, identifier et mesurer méthodiquement des molécules spécifiques. Des séparations rapides associées à une caractérisation spectrale de masse rapide et époustouflante et à la génération de profils analytiques en quelques minutes contenant des quantités incompréhensibles de données. Comme le dit le vieil adage, « les arbres ne cachent pas la forêt ». La prise de conscience est qu'à l'ère de la richesse des données, nous n'avons plus besoin d'isoler, de caractériser et de mesurer méthodiquement des molécules spécifiques. Ce qui est important, c'est d'identifier laquelle des centaines ou milliers de molécules « inconnues » résolues et mesurées est associée à la pathologie qui nous intéresse. L'objectif est de trouver des marqueurs pertinents sur le plan clinique et l'examen statistique des modèles d'association est le nouveau mantra de l'analyste biomédical - ce que l'on appelle l'analyse au fusil de chasse. Cependant, comme tout scientifique biomédical clinique vous le dira, un biomarqueur doit être robuste, facile, rapide et peu coûteux à mesurer pour être adopté dans un laboratoire hospitalier. Toute analyse par microscopie électronique doit tenir compte de ces contraintes et ne pas se contenter d'identifier les valeurs statistiques aberrantes qui ne sont observées que parfois dans quelques échantillons et pas de manière cohérente dans la majorité des pathologies en question. Nous avons appliqué le logiciel SIMCA P+ plus à l'analyse métabolomique par microscopie électronique de l'urine de grossesse.