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Abstrait

Progrès récents dans l'identification informatique des sites N 6 -méthyladénosine chez Saccharomyces cerevisiae

Kuo-Chen Chou

La N ⁶ -méthyladénosine (m ⁶ A) joue un rôle essentiel dans un large éventail de processus biologiques. La connaissance de l'emplacement précis du site m ⁶ A dans le transcriptome est essentielle pour déchiffrer ses fonctions biologiques. Bien que les techniques expérimentales aient apporté des contributions substantielles à l'identification des méthylations m ⁶ A, elles restent laborieuses, coûteuses et chronophages. En tant que bons compléments aux méthodes expérimentales, au cours des dernières années, une série d'approches informatiques ont été proposées pour identifier les sites m ⁶ A dans Saccharomyces cerevisiae . Afin de faciliter la sélection des méthodes appropriées pour l'identification des sites m ⁶ A par les chercheurs, il est nécessaire de fournir un examen et une comparaison complets des méthodes informatiques existantes. Dans cette revue, nous avons résumé les progrès actuels dans la prédiction informatique des sites m ⁶ A et avons également évalué les performances des méthodes informatiques pour l'identification des sites m ⁶ A sur un ensemble de données indépendant. Enfin, les défis et les orientations futures de l'identification informatique des sites m ⁶ A ont également été présentés. Dans l’ensemble, nous prévoyons que cette revue fournira un guide important pour l’analyse informatique future de m ⁶ A et d’autres modifications de l’ARN.