Recherche immunitaire
Libre accès
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Huynh-Hoa Bui, Jason Botten, Nicolas Fusseder, Valerie Pasquetto, Bianca Mothe, Michael J Buchmeier et Alessandro Sette
Contexte : Les arénavirus sont une famille de virus transmis par les rongeurs qui provoquent plusieurs fièvres hémorragiques. Ces maladies peuvent être dévastatrices et souvent mortelles. Dans le présent document, pour aider à la conception et au développement de diagnostics, de traitements et de vaccins contre les infections à arénavirus, nous avons développé une base de données contenant des séquences protéiques des sept arénavirus pathogènes (Junin, Guanarito, Sabia, Machupo, Whitewater Arroyo, Lassa et LCMV). Résultats : La base de données contient actuellement un ensemble non redondant de 333 séquences protéiques qui ont été annotées manuellement. Toutes les entrées ont été liées au NCBI et aux références PubMed citées. La base de données dispose d'une interface de requête pratique comprenant la recherche BLAST. Des analyses de variabilité de séquence ont également été effectuées et les résultats sont hébergés dans la base de données. Conclusion : La base de données est disponible à l'adresse http://epitope.liai.org:8080/projects/arena et peut être utilisée pour aider aux études qui nécessitent des informations protéomiques sur les arénavirus pathogènes.