Chimiothérapie : Libre accès
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Abstrait

Marqueur pronostique de MMP9 lié à l'infiltration des cellules immunitaires dans le microenvironnement tumoral du cancer de la vessie

Han-Sheng Lin, Wan-Wan Liu, Neng-Zhuo Feng, Shuang-Ze Zhong, Shang-Jin Chen, Jing-Wei He*, Jian Liang*

Contexte : Le cancer de la vessie (BLCA) est l'un des cancers humains les plus courants et son incidence est en augmentation, en particulier chez les femmes. Le microenvironnement tumoral (TME) joue un rôle important dans le développement et la progression de la tumeur. Nous avons étudié les profils d'expression du BLCA dans la base de données du programme Cancer Genome Atlas et étudié les gènes susceptibles d'affecter la composition du microenvironnement tumoral (TME). Nous avons ensuite analysé la relation entre les gènes et le pronostic tumoral, à la recherche de marqueurs pronostiques immunitaires susceptibles de conduire à de nouveaux styles de diagnostic et de traitement du BLCA.

Méthodes : Nous avons obtenu les données RNA-seq de BLCA à partir du Cancer Genome Atlas (TCGA) ; nous avons utilisé l'algorithme de données Estimation of Stromal and Immune Cells in the Malignant Tissues Expression (ESTIMATE) pour calculer le score immunitaire et stromal. Les gènes différentiellement exprimés ont été traités dans une analyse de régression COX et utilisés pour construire un réseau d'interaction protéine-protéine (PPI).

Résultats : L'analyse d'intersection a démontré que la métalloprotéinase matricielle 9 ( MMP9 ) est le seul gène de croisement. Nous avons calculé le pourcentage de cellules immunitaires infiltrant la tumeur (TIC) dans le BLCA grâce à l'algorithme d'identification du type cellulaire par estimation des sous-ensembles relatifs de transcrits d'ARN (CIBERSORT). Les différences dans les groupes d'expression élevée et faible de MMP9 dans les TIC ont été établies. Les niveaux d'expression de MMP9 dans chaque type de TIC ont ensuite été corrélés. Grâce aux analyses de survie, cliniques et d'enrichissement, MMP9 s'est avéré être un facteur pronostique immunitaire pour le BLCA et joue un rôle significatif dans le microenvironnement tumoral. En fin de compte, l'analyse de corrélation entre MMP9 et les gènes du point de contrôle immunitaire a indiqué que MMP9 peut prédire l'effet de l'immunothérapie sur le BLCA.

Conclusion : MMP9 est un gène marqueur pronostique immunitaire. MMP9 est impliqué dans la régulation du processus immunologique du BLCA par de multiples voies et est étroitement lié aux cibles immunitaires PD-1 et CTLA4. L'expression de MMP9 peut avoir un impact sur le pronostic du BLCA, indiquant qu'il pourrait s'agir d'un marqueur pronostique du BLCA.