Recherche immunitaire
Libre accès
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Mawadda Abd-Elraheem Awad-Elkareem, Soada Ahmed Osman, Hanaa Abdalla Mohamed, Hadeel Abd-Elrahman Hassan, Ahmed Hamdi Abu-haraz, Khoubieb Ali Abd-elrahman et Mohamed Ahmed Salih
Le polyomavirus des cellules de Merkel est un virus à ADN double brin non enveloppé appartenant à la famille des Polyomaviridae et associé à une tumeur maligne cutanée agressive rare. Le mauvais pronostic et la compréhension limitée de la pathogénèse de la maladie justifient un traitement innovant. Dans cette étude actuelle, nous visons à prédire les épitopes immunogènes des cellules tuberculeuses à partir de la protéine VP1 de toutes les souches de polyomavirus des cellules de Merkel, ce qui contribuera à la conception efficace d'un vaccin basé sur les épitopes en utilisant des approches immunoinformatiques. Nous avons récupéré 423 séquences protéiques VP1 complètes d'espèces de virus polyomavirus des cellules de Merkel à partir de la base de données NCBI. Ces séquences ont été analysées pour déterminer la région conservée et ont été utilisées pour prédire les épitopes à l'aide des algorithmes immunoinformatiques IEDB. Pour les cellules B, trois épitopes ont été prédits comme vaccin peptidique (QEKTVY, KTVYPK et QEKTVYP). Pour les cellules T, les peptides de classe I prédits (SLFSNLMPK, LQMWEAISV et LLVKGGVEV) se sont avérés couvrir le nombre maximal d'allèles du CMH I. Les peptides de liaison du CMH de classe II ayant obtenu les scores les plus élevés étaient (IELYLNPRM, ISSLINVHY et INSLFSNLM). D'autres expériences devront être entreprises pour confirmer le potentiel de ces épitopes prédits dans le développement futur d'un vaccin efficace.