Journal d'immunologie clinique et cellulaire
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Abstrait

Le facteur de pluripotence PBX1 prédit l'efficacité du traitement de la polyarthrite rhumatoïde

Karin ME Andersson1 , Eric Malmhäll-Bah1 , Nina Y.Oparina1 , Weiyang Tao1 , Aridaman Pandit2 , Malin C. Erlandsson1,3, Venkataragavan Chandrasekaran1 , Sofia T. Silfverswärd1 , Rille Pullerits1,3,4, Maria I. Bokarewa1,3*

Objectif : Nous étudions les mécanismes moléculaires derrière la reconstitution des lymphocytes T dans la polyarthrite rhumatoïde (PR) en nous demandant si PBX1, un facteur de transcription qui maintient la pluripotence des cellules souches, prédit la réponse au traitement antirhumatismal.

Méthodes : La transcriptomique du génome entier par séquençage de l'ARN a été réalisée sur des cellules T CD4 ⁺ de 87 patients atteints de PR avec une faible activité de la maladie et de 78 patients atteints de PR avec une activité élevée de la maladie. Les résultats du traitement dans les groupes PBX1 ^hi et PBX1 ^lo ont été comparés. Le phénotype et les processus biologiques associés à PBX1 ont été identifiés par regroupement des gènes exprimés de manière différentielle dans les cellules CD4 ^{+ PBX1 hi . Les clusters PBX1 hi} dans le thymus ont été identifiés par une analyse basée sur une cellule unique. Les cibles transcriptionnelles de PBX1 parmi les DEG ont été prédites par l'analyse intégrative du motif de l'ADN, le séquençage de l'immunoprécipitation de la chromatine et les données de chromatine ouverte.

Résultats : Les cellules PBX1 ^hi CD4 ⁺ avaient des caractéristiques imprimées de pluripotence et manquaient de production de cytokines. Dans la PR active, les cellules PBX1 ^hi étaient enrichies en progéniteurs lymphocytaires préthymiques CD34 ^{+ . Les patients PBX1 hi} avaient une meilleure réduction de DAS28 sous traitement anti-TNF et une faible fréquence de non-répondeurs par rapport aux patients PBX1 ^lo (tous deux, p = 0,026). Dans la PR inactive, les cellules PBX1 ^hi étaient enrichies en cellules T naïves post-thymiques exprimant CD62L/SELL et CD31/PECAM1. Ici, les patients PBX1 ^hi ont nécessité moins de traitement pour atteindre la rémission par rapport aux patients PBX1 ^lo (p = 0,011). Dans le thymus, CD34 et PECAM1 ont été annotés dans les clusters PBX1 ^hi . L'analyse intégrative a révélé que les gènes centraux de maturation des cellules T TBX21, PRDM1, BATF3 et KLF1 dépendaient transcriptionnellement de PBX1.

Conclusion : Cette étude montre que l’enrichissement en PBX1 est associé au phénotype pluripotent des cellules CD4 ⁺ , ce qui favorise les réponses au traitement dans la PR.