ISSN: 1745-7580
Jan Slingenbergh
Chez la faune sauvage, réservoir naturel de la plupart des virus animaux, les infections cliniques manifestes sont généralement absentes. Dans cet article, nous émettons l'hypothèse que pendant des centaines de millions d'années, les virus ont co-évolué avec les arthropodes, les poissons, les amphibiens, les reptiles, les oiseaux et les mammifères, de manière amicale, en minimisant les coûts de réplication du virus et les dommages causés à l'hôte. Cette hypothèse de mutualisme virus-hôte peut être considérée comme diamétralement opposée à l'hypothèse de transmission de la virulence. En nous appuyant sur des travaux antérieurs, nous examinons plus en détail les écologies de transmission de 36 des principaux virus du bétail du monde. Les virus et les systèmes organiques sont alignés sur des bases écologiques, de l'extérieur vers l'intérieur du corps. L'interaction virus-hôte passe d'une infection aiguë à une infection persistante à une intimité toujours plus grande entre le virus et l'hôte. De l'extérieur vers l'intérieur du corps, le mutualisme virus-hôte est en augmentation. L'antagonisme virus-hôte augmente de l'intérieur vers l'extérieur du corps. Nous explorons également le rôle du domaine de l'hôte dans l'évolution du mutualisme-antagonisme. Pour cela, la trajectoire d'évolution du virus lors d'un transfert d'hôte de la faune sauvage vers l'homme ou le bétail est examinée. Là encore, les virus épithéliaux sont comparés aux virus non épithéliaux, entièrement internalisés. On constate que les virus entériques acliniques des oiseaux sauvages et des chauves-souris, chez l'homme et le bétail, évoluent en tant qu'agents pathogènes respiratoires ou également entériques. La virulence virale est la plus importante parmi les virus respiratoires et entériques de la volaille et du porc. En ce qui concerne les virus internalisés, on constate que lors d'un transfert de la faune sauvage vers l'homme ou le bétail en tant qu'hôte, le virus évolue pour revenir au profil de trait sylvatique, très progressivement. Collectivement, les résultats de cette étude corroborent l'idée que dans les écosystèmes naturels, les relations amicales virus-hôte ont tendance à être sélectionnées. L'évolution de la virulence virale et d'autres formes d'aptitude pathogène, y compris l'immunosuppression, se produit principalement dans l'élevage de masse d'animaux et est donc de nature anthropique. Les agents de la foule circulant chez l'homme en tant qu'hôte occupent une position intermédiaire.