Techniques avancées en biologie et médecine
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ISSN: 2379-1764
ISSN: 2379-1764
Ahmed Hamdi Abu-haraz * , Khoubieb Ali Abd-elrahman, Mojahid Salah Ibrahim, Waleed Hassan Hussien, Mohammed Siddig Mohammed, Marwan Mustafa Badawi et Mohamed Ahmed Salih
Le virus Ebola du Soudan est un génome à ARN monocaténaire à polarité négative appartenant à la famille des Filovirus Filoviridae qui provoque une fièvre hémorragique. Il n'existe aucun traitement ni vaccin contre ce virus, c'est pourquoi l'objectif de cette étude est de concevoir un vaccin peptidique à l'aide d'approches immunoinformatiques pour analyser la glycoprotéine de toutes les souches du SUDV, afin de déterminer la région conservée qui est ensuite étudiée pour prédire tous les épitopes possibles qui peuvent être utilisés comme vaccin peptidique. Au total, 21 glycoprotéines du virus Ebola du Soudan extraites de la base de données NCBI ont été alignées pour déterminer la conservation et prédire les épitopes à l'aide de la ressource d'analyse IEDB. Trois épitopes ont été prédits comme vaccin peptidique pour les cellules B (PPPPDGVR, ETFLQSPP, LQSPPIRE). Pour les cellules T, quatre épitopes ont montré une forte affinité pour la classe I du CMH (FLYDRLAST, IIIAIIALL, MHNQNALVC et RTYTILNRK) et une couverture élevée contre le Soudan et l'ensemble de la population mondiale. Également dans la classe II du CMH, quatre épitopes interagissent avec les allèles les plus fréquents de la classe II du CMH (FAEGVIAFL, FLRATTELR, FLYDRLAST et FVWVIILFQ) avec une couverture élevée contre le Soudan et l'ensemble de la population mondiale. Nous recommandons une étude in vivo et in vitro pour prouver l'efficacité de ces épitopes prédits en tant que vaccin peptidique.