Journal des sciences théoriques et computationnelles
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Abstrait

Modélisation moléculaire et analyse de l'amarrage du CYP1A1 associé au cancer de la tête et du cou pour explorer ses régions de liaison

Cheikh Arslan Sehgal, Rana Adnan Tahir, Shagufta Shafique, Mubashir Hassan et Sajid Rashid

Le cytochrome P450, famille 1, sous-famille A, polypeptide 1 est une enzyme de phase I de la superfamille du cytochrome P-450 (CYP) impliquée dans la détoxification ou la conversion des carcinogènes en une forme plus électrophile, métabolisée par des enzymes de phase II. Ces enzymes de détoxification ont été largement étudiées en association avec le cancer de la tête et du cou. Plusieurs outils bioinformatiques sont appliqués à la modélisation du CYP1A1 et à son évaluation. La modélisation basée sur l'homologie à partir du modèle 2HI4 a été réalisée par le logiciel bioinformatique MODELLER 9v10. Tous les outils d'évaluation ont confirmé la fiabilité du modèle prédit. Les poches de liaison ont été révélées pour les études de liaison. L'inhibiteur (C6H13FN2O2) a montré une affinité de liaison maximale contre le CYP1A1. Des études d'amarrage ont révélé que Leu-21, Val-22, Phe-23, Gly-42, Pro-43, Gly-45, His-51, Gln-75 et Ile-76 sont des résidus essentiels pour l'interaction récepteur-ligand. Nous proposons que la structure prédite soit fiable pour les informations structurelles et les études fonctionnelles et que l'inhibiteur sélectionné puisse être plus puissant pour le cancer de la tête et du cou. Une analyse plus approfondie de cet inhibiteur par mutagenèse dirigée pourrait être utile pour explorer les détails des poches de liaison des ligands. Dans l'ensemble, les résultats de cette étude peuvent être utiles pour concevoir de nouvelles cibles thérapeutiques pour guérir le cancer de la tête et du cou.