Anesthésie et recherche clinique
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Abstrait

Ancrage moléculaire et analyse des ligands générés in silico contre les protéines Spike et Replicase du SARSCoV-2

Ifeanyichukwu Okeke*, Cosmas Okeke

Par le biais d'un amarrage moléculaire, une bibliothèque de ligands générés in silico a été amarrée aux protéines de pointe et de réplicase du SARS-CoV-2 pour identifier les pistes ayant tendance à les lier avec une affinité élevée. Les pistes identifiées se sont avérées lier ces protéines avec une affinité plus forte que le ligand natif, facilitant ainsi leurs processus métaboliques in vivo . Il a ainsi été observé que la protéine de pointe se lie à son récepteur cellulaire avec une affinité de liaison de -4,8 Kcal/mol ; elle se lie à un analogue non cellulaire avec -5,4, tandis que 4twy 3BL et 5n19 D03 se lient à la protéine de pointe avec des affinités de liaison de -7,3 Kcal/mol chacune. Ils se lient également à la protéine de réplicase avec respectivement -8,2 et -7,2 Kcal/mol. Les résultats indiquent que les ligands identifiés peuvent déplacer ou inhiber de manière préférentielle la liaison des protéines virales à leurs ligands endogènes natifs et que la fixation cellulaire par l'interaction de la pointe et de l'ACE2, ainsi que le processus de réplication virale peuvent tous deux être inhibés en utilisant une seule des substances identifiées. D'après l'étude, 5c8s G3A et 2d2d ENB ont été identifiés comme les pistes les plus appropriées et favorablement disposées pour la détection de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 à partir d'échantillons biologiques, tandis que 3d62 959 et 1r4l XX5 ont été identifiés comme les pistes présentant la ressemblance médicamenteuse la plus appropriée contre le SRAS-CoV-2 sur la base des filtres de SwissADME et de Molinspiration chimioformatics et méritent donc d'autres évaluations in vitro et in vivo .