Recherche immunitaire
Libre accès
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Joseph M Volpe et Thomas B Kepler
Contexte : Les processus impliqués dans l'assemblage somatique des gènes récepteurs d'antigènes sont propres au système immunitaire et sont en grande partie déterminés par des événements aléatoires. Des biais subtils peuvent cependant exister et fournir des indices sur les mécanismes moléculaires impliqués dans leur assemblage et leur sélection. Des efforts à grande échelle pour fournir des données de base sur les caractéristiques génétiques des gènes d'immunoglobuline (Ig) et les mécanismes impliqués dans leur assemblage sont récemment devenus possibles en raison de la croissance rapide des bases de données génétiques. Résultats : Nous avons rassemblé et analysé près de 6 500 gènes productifs de chaînes lourdes d'Ig humaines et les avons comparés à 325 gènes d'Ig non productifs qui ont été réarrangés à l'origine hors cadre et donc incapables d'être biaisés par la sélection. Nous avons trouvé des preuves de différences dans les distributions de longueur des séquences de n-nucléotides qui ont des interprétations intéressantes pour les mécanismes impliqués dans la polymérisation des n-nucléotides. De plus, nous avons trouvé des preuves statistiques frappantes de préférences d'appariement entre les segments D et J. Nous présentons un modèle statistique pour étayer notre hypothèse selon laquelle ces biais d'appariement sont dus à de multiples réarrangements séquentiels de D à J. Conclusion : Nous présentons ici les estimations les plus précises des fréquences d'utilisation des segments de gènes actuellement disponibles, ainsi que des analyses concernant les distributions de n-nucléotides et les préférences de paires de segments DJ. De plus, nous fournissons la première preuve statistique que des recombinaisons DJ séquentielles se produisent au locus de la chaîne lourde humaine pendant l'ontogénie des cellules B avec une fréquence approximative de 20 %.