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Abstrait

Prédiction in silico d'un vaccin à base de peptides contre le virus de la variole aviaire (FPV)

Idris ST, Salih S, Basheir M, Elhadi A, Kamel S, Abd-elrahman KA, Hamdi A et Hassan MA

Le virus de la variole aviaire (FPV) est un virus à ADN double brin et un membre de la famille des Poxviridae qui se transmet par aérosols et piqûres d'insectes et provoque une infection cutanée et diphtérique dans la population de volailles. Cette étude visait à concevoir un vaccin peptidique en sélectionnant tous les épitopes possibles après avoir analysé toutes les séquences protéiques FPV140 rapportées dans la base de données NCBI en utilisant des approches in silico . Après l'alignement de la séquence récupérée, la région conservée a été appliquée dans l'outil d'analyse IEDB pour prédire les épitopes des cellules B et T, puis en testant l'affinité des épitopes prédits à se lier au récepteur de poulet (BF2*2101) (BF2*0401) pour la molécule MHC1, les peptides à faible énergie lorsqu'ils sont amarrés au récepteur ont été suggérés comme vaccin à base d'épitopes. Français Les peptides (50 PPSPKP 55, 51 PSPKPL 56, 52 SPKPLP 57, 53 PKPLPK 58, 54 KPLPKS 59, 55 PLPKSK 60, 56 LPKSKQ 61 et 18 RPSSTV 23) étaient les épitopes les plus potentiels des cellules B tandis que (110 YIMDNAEKL 118, 274 FYHRMYYPL 282, 278 MYYPLFSVF 286 231 YVVDNDRYV 239 et 317 LLSGVFLAY 325) des épitopes amarrés suggérés comme étant des épitopes des cellules T en raison de leur bonne affinité de liaison, en particulier celui-ci chevauché 110 YIMDNAEKL 118. Cette étude a conclu que ces épitopes prédits pourraient être utilisés pour produire un bon vaccin contre le FPV après des études in vitro et in vivo pour évaluer son efficacité.