Journal d'immunologie clinique et cellulaire
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Abstrait

Vaccin basé sur l'immunoinformatique et modélisation in silico pour la glycoprotéine G du virus de la rage de Duvenhage

Sahar Obi Abd Albagi, Omar Hashim Ahmed, Manal Abdalla Gumaa, Khoubieb Ali Abd_elrahman, Ahmed Hamdi Abu-Haraz et Mohammed A. Hassan

Contexte : Le virus de la rage de Duvenhage appartient à la famille des Lyssavirus Rhabdoviridae, provoquant une infection mortelle sans traitement efficace disponible et sans vaccin ADN ou peptidique homologué à ce jour. L'objectif de la présente étude était de prédire un vaccin peptidique contre le virus de la rage de Duvenhage.
Méthodes et matériels : Les séquences du virus de Duvenhage ont été choisies auprès du NCBI, puis elles ont été soumises à de nombreux tests de cellules B et de cellules T de l'IEDB pour réaliser les peptides les plus prometteurs qui pourraient agir comme vaccin à peptides pilotés. Une analyse de couverture de population a été réalisée pour des peptides sélectionnés à l'aide de l'IEDB et enfin une modélisation d'homologie et des études d'amarrage moléculaire ont été réalisées pour visualiser l'interaction avec les molécules MHC1. Français
: Résultat et conclusion : Parmi les peptides testés pour le test des cellules T, cette étude a projeté un épitope intéressant des cellules T (YFLIGVSAV) qui présente une affinité de liaison dévorante comme indicateur fort des allèles MHC-1 et MHC-2 ensemble, en plus de la liaison à dix-huit allèles à travers la couverture de population de 99,36 % dans le monde. Ces résultats ont été en outre confirmés par des études d'amarrage moléculaire qui montrent une excellente interaction avec la molécule MHC homo spins avec la plus faible énergie de liaison parmi les peptides testés.
Seuls trois épitopes des cellules B (AHYK, YTIPDKL et SLHNPYPDSH) se sont avérés chevaucher tous les tests des cellules B effectués en étant linéaires, à la surface de la glycoprotéine G et en étant antigéniques.