Recherche immunitaire
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ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Malaz Abdelbagi, Tarteel Hassan, Mohammed Shihabeldin, Sanaa Bashir, Elkhaleel Ahmed, Elmoez Mohamed, Shawgi Hafiz, Abdah Abdelmonim, Tassneem Hamid, Shimaa Awad, Ahmed Hamdi, Khoubieb Ali et Mohammed A. Hassan
Contexte : La peste équine africaine (AHS) est une maladie virale des équidés. Elle est transmise par les moucherons Culicoides hématophages (Diptera, Ceratopogonidae) et provoque une maladie grave chez les chevaux pouvant entraîner la mort. Le virus de la peste équine africaine (AHSV) est un virus à ARN double brin (dsRNA) avec dix segments de génome codant sept protéines structurales (VP1-VP7) et quatre protéines non structurales (NS1, NS2, NS3, NS3A). Le but de cette étude est d'analyser la protéine (VP2) des souches du virus de la peste équine africaine (AHSV) rapportées dans la base de données du National Center for Biotechnology Information (NCBI) afin de sélectionner tous les épitopes possibles qui peuvent être utilisés pour concevoir un vaccin peptidique.
Matériel et méthodes : Un total de 27 séquences de protéines de capside externe (VP2) du virus de la peste équine africaine (AHSV) ont été récupérées de la base de données du National Center for Biotechnology Information (NCBI) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/?term=VP2+African+horse+sickness+virus) le 7 septembre 2016. Sur elles, plusieurs tests ont été réalisés en utilisant la base de données d'analyse des épitopes immunitaires (IEDB) pour détecter les épitopes immunogènes hautement conservés des cellules B et T parmi lesquels tous les épitopes possibles pouvant être utilisés comme vaccin peptidique thérapeutique doivent être sélectionnés.
Résultats et discussion : Concernant les épitopes qui pourraient provoquer une réponse immunitaire anticorps, « FSPEYY, DKVVEDPESY et YDTDQNVV » ont été proposés pour stimuler les cellules B. Alors que 5 épitopes pour chaque CMH I et II ont été considérés comme des épitopes potentiellement prometteurs car ils se lient au plus grand nombre d'allèles, tous ces épitopes se sont avérés avoir une affinité de liaison élevée et la plus faible énergie de liaison à l'haplotype de molécule de classe I du CMH équin (ELA-A3) au niveau structurel. Les épitopes « YAYCLILAL et YTFGNKFLL » ont été représentés car ils étaient liés au plus grand nombre d'allèles. Malgré la liaison à 4 allèles, l'épitope WFFDYYATL a été représenté car il a la plus faible énergie globale. À notre connaissance, il n'existe pas de vaccin basé sur un épitope pour le virus de la peste équine africaine (AHSV) utilisant des approches in silico.