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Abstrait

Approche immunoinformatique - Conception d'un vaccin à peptides multiples à partir de la glycoprotéine E du virus de l'herpès simplex-3

Sahar Obi Abd Albagi, Safaa Hag Ahmed, Thana Eljozoli Mohamme, Esameldeen Ahmed Adam et Mohammed A Hassan

Contexte : Le virus de l'herpès simplex (HSV) est un agent pathogène humain courant, provoquant des infections des surfaces muqueuses orofaciales (HSV-1) et des surfaces muqueuses génitales (HSV-2). Une infection productive entraîne la formation de lésions vésiculaires dans les épithéliums muqueux, suivie de la propagation du virus aux neurones sensoriels et de l'établissement d'une infection latente qui peut rester toute la vie de l'hôte.
Matériel et méthode : Toutes les séquences de la glycoprotéine E [virus de l'herpès humain 3] ont été obtenues auprès du NCBI et ces séquences ont été soumises aux outils prédits par l'IEDB, notamment l'examen des cellules B et des cellules T, les cellules B ayant plusieurs tests tels que la prédiction des épitopes, l'accessibilité de surface et la prédiction de l'antigénicité ; les cellules T comprenaient les outils prédits du CMH I et du CMH II. Enfin, nous avons utilisé la couverture de population pour sélectionner le pourcentage le plus élevé de peptides liés à différents allèles.
Français : Résultat : Nous avons obtenu des peptides candidats en tant que peptides dérivés du vaccin à partir du test des cellules B qui avaient un score le plus élevé dans l'accessibilité de surface Emini (« DEDKLDTNSVYEPYYHSDHAESSWVNRGESSRKAYDHNSPYIWPRNDYDGF ») de 21,807, et « LKFVDTPESL » avec un score de 1,061 pour le test d'antigénicité de Kolaskar et Tongaonkar, d'autre part nous avons obtenu une affinité la plus élevée des peptides qui ont interagi avec une couverture majeure de différents allèles dans le CMH I (« KAYDHNSPY ») et dans le CMH II (« MWNYHSHVF »).
Conclusion : Le degré d'efficacité et de sécurité des épitopes candidats prédits par des méthodes d'examen informatique doit être estimé au moyen d'études sur des modèles animaux, pour vérifier s'ils sont capables d'induire une bonne réponse immunitaire de défense ou non avec les propriétés mentionnées précédemment, et nous avons considéré cette étude comme le premier vaccin peptidique prometteur à base de peptides de la glycoprotéine E [du virus de l'herpès humain 3] par rapport aux études précédentes.