Recherche immunitaire
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ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Omar Hashim Ahmed, Arwa Abdelhalim, Sahar Obi, Khoubieb Ali Abd_elrahman, Ahmed Hamdi et Mohammed A.Hassan
Contexte : Le virus de la rage de Lagos appartient au genre lyssavirus responsable de la méningo-encéphalomyélite chez les mammifères qui affecte des millions de personnes dans le monde et cause des milliers de décès humains chaque année. À notre connaissance, il n'existe pas de vaccin peptidique conçu pour le virus de la rage de Lagos. Le vaccin peptidique résultant devrait être plus immunogène et moins allergique que les vaccins biochimiques conventionnels. Le but de cette étude était de concevoir un vaccin peptidique Insilco pour le virus de la rage de Lagos en utilisant des outils immuno-informatiques.
Méthodes et matériels : Les séquences de la glycoprotéine G du virus de la rage de Lagos ont été récupérées auprès du NCBI, les séquences récupérées ont ensuite été traitées à l'aide de différents outils immuno-informatiques pour les cellules B afin de découvrir les épitopes de surface et antigéniques les plus conservés, et pour les cellules T afin de trouver les peptides conservés et de tester leur affinité de liaison à différents allèles MHC1 et MHC11. Français Ensuite, une analyse de couverture de population et une modélisation d'homologie ont été réalisées pour les épitopes les plus prometteurs afin de montrer leurs positions structurelles dans la glycoprotéine G.
Résultats et conclusions : Des tests sur les cellules B ont été réalisés pour Bepipred avec 22 épitopes conservés, la prédiction de l'accessibilité de surface Emini avec 12 épitopes de surface conservés et le test d'antigénicité de Kolaskar et Tongaonkar avec seulement trois épitopes conservés étant antigéniques. 23 épitopes conservés ont interagi avec différents allèles du CMH-1 avec (IC50) ≤ 500 tandis que 39 épitopes conservés ont interagi avec les allèles du CMH-II avec (IC50) ≤ 1000. Parmi tous les épitopes testés pour la couverture de la population mondiale, la liaison de l'épitope FVGYVTTTF aux allèles MHC1 et MHC11 était de 97,30 % et il s'est avéré se lier à 13 allèles différents qui indiquent un fort potentiel pour formuler un vaccin peptidique contre le virus de la rage de Lagos.