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Abstrait

Identification de nouveaux microARN et prédiction de leur cible dans Stevia rebaudiana

Vibha Mandhan et Cachemire Singh

Stevia rebaudiana Bertoni, en raison de son importance nutritionnelle et de son utilisation émergente comme édulcorant naturel, suscite l'attention dans le monde entier. Pour mieux comprendre le réseau de régulation des gènes de cette plante, nous avons lancé un séquençage à haut débit de petits ARN pour découvrir de nouveaux microARN (miARN). Les miARN sont une classe de petites molécules d'ARN endogènes non codantes courtes d'environ 18 à 22 nucléotides de longueur dont la fonction principale est de réguler à la baisse l'expression des gènes de différentes manières comme la répression de la traduction, le clivage de l'ARNm et la modification épigénétique. Nous avons construit une bibliothèque d'ARNs de S. rebaudiana et après l'avoir séquencée à l'aide de l'analyseur de génome Illumina II, un total de 30 472 534 lectures représentant 2 509 190 séquences distinctes ont été obtenues. À partir de ces lectures, douze 12 nouveaux miARN ont été prédits dont les précurseurs ont été potentiellement générés à partir de séquences EST et nucléotidiques de stevia. Toutes les nouvelles séquences n'ont pas été décrites auparavant dans la stevia ou d'autres espèces végétales. Des gènes cibles putatifs ont été prédits pour la plupart des nouveaux miRNA, qui comprennent principalement des ARNm codant des enzymes régulant les voies métaboliques et de signalisation essentielles des plantes. Nos résultats ont augmenté le nombre de miRNA dans la stévia, ce qui devrait être utile pour des recherches plus approfondies sur les fonctions biologiques et l'évolution des miRNA dans la stévia et d'autres espèces végétales.