ISSN: 2471-9315
Shiyin Liu, Yingxin Tang, Dechen Wang, Nuoqiao Lin et Jianuan Zhou
Objectifs : Enterobacter est un genre comprenant de nombreuses espèces associées à une pertinence clinique, à des plantes, à des aliments et à des sources environnementales. Cependant, la taxonomie d'Enterobacter est compliquée et déroutante. Afin d'identifier la taxonomie de l'agent causal isolé à partir de bulbes d'oignons en décomposition en Chine et de fournir un exemple pour identifier les agents pathogènes des plantes, nous avons utilisé des technologies biochimiques en combinaison avec la biologie moléculaire pour confirmer le statut de l'agent pathogène.
Méthodes : Dans cette étude, des tests biochimiques, des analyses de morphologie coloniale et microscopique, un séquençage du gène rRNA 16S et une analyse des séquences multilocus (MLSA) basée sur le séquençage partiel de rpoB, atpD, gyrB et infB ont été réalisés sur les isolats obtenus à partir des bulbes d'oignon pourris. Selon les caractéristiques biochimiques et la relation génétique, nous avons comparé le pathogène avec des souches apparentées obtenues par alignement BLASTn. Enfin, un test de pathogénicité a été réalisé sur des bulbes d'oignon sains pour vérifier les postulats de Koch.
Résultats : Le test biochimique, la morphologie coloniale et microscopique électronique ont indiqué que le pathogène est gramnégatif, appartient au genre Lelliottia et, en combinaison avec l'analyse phylogénétique, il est très similaire à L. amnigena.
Conclusion : À notre connaissance, il s’agit du premier signalement de L. amnigena provoquant naturellement une pourriture molle sur des oignons récoltés.