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Abstrait

Identification et analyse des voies moléculaires et des biomarqueurs candidats clés dans le glioblastome multiforme

Aditi Stuti Kumari

Le glioblastome multiforme (GBM) est une tumeur maligne primaire de grade IV présente dans le système nerveux central. Malgré les progrès des traitements, son pronostic est sombre car la survie médiane est de 14 à 15 mois. L'objectif de cette étude était d'identifier les biomarqueurs candidats ainsi que les voies fonctionnelles régulées dans le GBM. L'ensemble de données (GSE100675) consulté comprenait 3 tissus de glioblastome, 3 tissus appariés et 3 tissus normaux. Les gènes différentiellement exprimés (DEG) ont été identifiés à l'aide de GEO2R, ​​qui a trouvé un total de 1 609 DEG (916 sous-régulés et 693 sur-régulés). Une ontologie génétique et une analyse de la voie KEGG ont été effectuées avec les DEG. L'analyse de la voie KEGG a ensuite été utilisée pour construire un réseau d'interactions protéine-protéine (PPI), identifiant les gènes d'intérêt. Le réseau d'interaction a ensuite été placé dans cytoscape et 10 gènes pivots ont été identifiés. Pour garantir la fiabilité de la recherche, ces gènes pivots ont été placés dans GEPIA et les données ont été comparées pour assurer la cohérence de la recherche, la régulation des 10 gènes pivots correspondant à celle d'un ensemble de données plus vaste. Une analyse de Kaplan-Meier a été réalisée sur les gènes pivots, qui a démontré qu'une régulation positive du transducteur de signal et activateur de transcription 3 (STAT3) était associée à une survie plus faible. L'étude montre que le gène STAT3 peut être un facteur clé dans la progression du GBM, étant crucial dans la prolifération cellulaire. En conclusion, STAT3, ainsi que les voies moléculaires identifiées, peuvent être utilisés comme biomarqueur pronostique et diagnostique potentiel et peuvent être utilisés pour approfondir notre compréhension du GBM.