Journal des sciences théoriques et computationnelles
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Abstrait

À quelle distance de la nature sommes-nous ? Analyse des similarités de corrélation entre les descripteurs de la banque de médicaments et les molécules tripeptides

Eitner K, Gawęda T, Koch U

Une analyse statistique a été réalisée sur les similitudes entre les descripteurs topologiques 2D de la base de données moléculaires de la Drug Bank et 8 000 tripeptides (toutes les combinaisons possibles d'acides aminés codées par des acides nucléiques). La corrélation entre les propriétés calculées théoriquement des molécules de tripeptides (MW, AlogP, PSA topologique, donneurs et accepteurs de liaisons hydrogène) et les descripteurs topologiques de la Drug Bank a montré des similitudes majeures entre les tripeptides simples et les composés à bioactivité dédiée développés en laboratoire. L'article présente des histogrammes pour la distribution du nombre de composés ayant des propriétés moléculaires similaires codées par les descripteurs. Une méthodologie simple et innovante pour l'analyse à grande échelle des données statistiques et leur corrélation a été développée dans le cadre de notre étude. Certaines hypothèses indiquent que les aliments hautement transformés constituent une barrière antibactérienne et antivirale naturelle. Nos recherches en comparaison avec les données de la littérature prouvent que de nombreux xénobiotiques sont topologiquement similaires aux métabolites naturels étant des tripeptides et certains ont des applications thérapeutiques similaires.