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Génomique 2019 : Analyse du transcriptome des verrues induites par le VPH et de la peau saine chez l'homme : une étude exploratoire

Laith N. Al-Eitan

Connus pour être la cause des grains de beauté chez les humains, les papillomavirus humains (HPV) sont un ensemble irrésistible d'infections à ADN qui se transmettent entre les personnes par contact peau à peau. En raison de la façon dont les grains de beauté sont présents chez 7 à 12 % de la population, l'infection par le HPV est une maladie généralement courante qui affecte environ 1 personne sur 10 au cours de sa vie. Après un examen approfondi de l'ensemble des écrits, il a été découvert qu'aucun article n'explorait les profils de qualité des grains de beauté provoqués par le HPV. Le point principal de cette étude est de déterminer s'il existe une différence dans les profils de qualité des grains de beauté et de la peau saine chez les personnes HPV+. La technologie du séquençage de l'ARN a été utilisée sans précédent en Jordanie pour déterminer s'il existe une différence de qualité des grains de beauté provoqués par le HPV et la peau saine. Les corrélations entre les grains de beauté provoqués par le HPV et la peau saine des patients arabes jordaniens ont été réalisées à l'aide du cadre de séquençage Illumina HiSeq 2500. Différents programmes bioinformatiques ont été utilisés pour mesurer l'articulation différentielle, l'étude de l'amélioration des ensembles de gènes, l'examen des voies et le regroupement des cartes thermiques. Les grains de beauté activés par le VPH se sont avérés avoir une marque génétique extrêmement grande et exceptionnelle. Un nombre important de gènes dirigés vers le haut ont été identifiés avec le cancer et l'infection (WIF1, HMGCS2, CLU et PTGIS), tandis que quelques gènes dirigés vers le bas étaient liés à un obstacle à la qualité (SPINK6, PI3, SERPINB4, SERPINB3). En outre, les 500 gènes les plus différentiellement communiqués se sont avérés être liés aux voies immunitaires et immunitaires, par exemple la dégranulation des neutrophiles, le trajet du récepteur de type 7/8 (TLR 7/8), le trajet du récepteur de type 9 (TLR9) et les voies du récepteur de type 10 (TLR10), entre autres. Les grains de beauté provoqués par le VPH ont une structure articulaire de qualité inimitable qui les distingue de la peau saine, mais qui partage de nombreuses caractéristiques pratiques avec d'autres maladies de la peau. Les futures pistes de recherche doivent explorer les caractéristiques d'intérêt révélées dans cette étude de manière individuelle pour déterminer le degré de leur pathogénicité.

The human papillomavirus (HPV) is a DNA infection that has been related with numerous sicknesses and is the complete reason for basically all cervical malignancy cases. Almost 200 sorts of HPV have been described, and these sorts are named high-danger or generally safe relying upon their capability to cause destructive or generous injuries, individually. 4.5% of new disease cases overall are brought about by high-hazard HPV contamination, however generally safe sorts regularly show as moles. Basic moles (Verruca vulgaris) are by a wide margin the most common sort of mole, making up 70% of all non-genital cutaneous moles, and are believed to be amiable in nature.

Human skin is made out of two layers, the epidermis and the dermis, and HPV only focuses on the lowermost epidermal layer, the layer basale, to set up a tenacious disease, after which it captures the keratinocyte separation measure with the end goal of the beneficial viral life cycle. Correspondingly, HPV science varies in basal and suprabasal keratinocytes, the last of which are associated with various phases of epithelial separation . Keratinocytes make up 90% of every single epidermal cell, and bothers to their separation make the skin more helpless to contamination and illness. Presently, there is no remedy for HPV itself, and its treatment centers around the lightening of clinical indications until the disease is normally cleared by the insusceptible framework . Nonetheless, there is no convincing proof concerning whether the infection is totally dispensed with from the body or essentially brought down to imperceptible levels.

While much examination has been committed to the hereditary qualities of HPV-related malignancies, there is a deficiency of data concerning the hereditary foundation of non-genital cutaneous moles, which shows a squeezing need to more readily comprehend their etiology. Consequently, the point of the current examination is to give a genome-wide correlation of the transcriptomes of basic moles and ordinary skin utilizing cutting edge sequencing.

The current investigation served to explain the hereditary foundation of HPV contamination with regards to non-genital cutaneous moles. The discoveries of the current examination featured dysregulation of various qualities which may assume a basic part in mole development, including KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3, and FCGRT. Moreover, a few insusceptible framework related pathways were discovered to be related with distinguished DE qualities including neutrophil degranulation, myeloid separation factor 88, and cost like receptors.

Nos données suggèrent également que peu de gènes impliqués dans la réaction immunitaire peuvent jouer un rôle fondamental dans la stimulation du processus d'infection par le VPH. En fait, l'étude de la signature des cellules immunitaires a montré des niveaux d'activité distincts de nombreuses cellules associées au système immunitaire, notamment les cellules NKT, DC et Treg. Un grand nombre des gènes impliqués dans les grains de beauté de la même manière n'ont pas fait l'objet d'études antérieures évaluées par des pairs, ce qui suggère de futures orientations et pistes de recherche axées sur ces gènes individuels ainsi que sur les exemples d'expression de différents types de VPH.