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Abstrait

Régulation génétique de la gelsoline dans le poumon chez la souris et son large spectre potentiel de fonctions biologiques

Xiaoyun Liu, Helin Feng, Jiaqian Zhu, Rachel Stein, Yue Huang, Yan Jiao et Xiaodong Zhu

Des études considérables ont été menées sur la fonction biologique potentielle de la gelsoline et son lien avec le système immunitaire humain, les maladies et autres troubles. L'objectif de notre étude était d'identifier les facteurs génétiques qui régulent la gelsoline dans le poumon de souris et d'analyser sa fonction dans le système immunitaire en utilisant des souches consanguines recombinantes bien définies. À cette fin, nous avons choisi les souches consanguines recombinantes BXD (RI) dérivées de la descendance des souches progénitrices C57BL/6J (B6) et DBA/2J (D2). L'expression génique du génome entier dans le poumon a été utilisée pour la cartographie eQTL. Des outils bioinformatiques et des données de génotypage ont été utilisés pour l'analyse des gènes candidats. Des processus de réseau et de corrélation de gènes ont été utilisés pour évaluer l'association entre la gelsoline et les traits biologiques. Les données ont indiqué qu'un eQTL sur le chromosome 9 couvrant une zone génomique comprise entre 21Mb et 30Mb joue un rôle majeur dans la régulation du niveau d'expression de la gelsoline. L'analyse des éléments génétiques dans cette région a révélé que Ncapd3 est le gène candidat le plus apprécié. Son niveau d'expression est fortement associé à celui de la gelsoline. Le niveau d'expression de la gelsoline entre les souches de souris avec deux génotypes de SNP (rs13480109) dans une région régulatrice du Ncapd3 a montré une différence significative. Des analyses d'association supplémentaires suggèrent que la gelsoline peut avoir un large spectre de fonctions biologiques. Le niveau d'expression de la gelsoline a une très forte corrélation avec les gènes dans une variété de fonctions biologiques. Ces gènes fortement associés sont principalement destinés à la liaison aux protéines. L'expression de la gelsoline est également corrélée à plusieurs phénotypes immunitaires connus. Ces données contribuent de manière significative à nos connaissances actuelles sur la fonction biologique de la gelsoline.