ISSN: 1948-5964
Valinciute A, Kiveryte S et Mauricas M
Contexte : Le virus GB-C (GBV-C), également connu sous le nom de virus de l'hépatite G (HGV), est un virus enveloppé dont le génome contient un ARN simple brin d'environ 9,4 kb de longueur. En raison de la similitude de la structure du génome avec le VHC, le virus GBV-C est classé dans la famille des virus Flaviviridae. Le virus GBV-C est réparti dans le monde entier et les infections virales sont courantes chez les donneurs de sang sains ainsi que chez les personnes immunodéprimées. Des études antérieures ont montré un taux élevé de co-infection GBV-C chez les personnes atteintes du virus de l'hépatite C (VHC) et du virus de l'immunodéficience humaine (VIH). En raison des différences génétiques entre les séquences de la région 5' non traduite (5'UTR) des isolats GBV-C, le virus est classé en sept génotypes principaux et en plusieurs sous-types. La répartition des génotypes GBV-C varie géographiquement et les informations sont encore incomplètes. Français L'objectif de cette étude était de déterminer la fréquence du GBV-C et les génotypes du GBV-C parmi les individus positifs au VHC en Lituanie.
Méthodes : Dans cette étude, l'ARN du GBV-C a été isolé à partir d'échantillons de sérum de 170 patients atteints d'une infection connue par le VHC. La réaction de transcriptase inverse imbriquée a été utilisée pour synthétiser l'ADN complémentaire (ADNc) et le fragment de 210 pb de la région 5'UTR a été amplifié par RT PCR imbriquée. Les produits de PCR ont été séquencés et soumis à une analyse phylogénétique en utilisant des séquences de référence de chaque génotype obtenues auprès de GenBank (n = 46). L'analyse a été calculée à l'aide de CLC bio version 6.6.5 et MEGA 5.2.
Résultats : Parmi 170 patients positifs au VHC, 36 (21,17 %) étaient positifs pour le GBV-C. Sur la base de l'analyse phylogénétique d'une courte région (210 pb) dans la région 5'UTR, deux génotypes, 2a et 3, ont été classés.
Conclusions : Dans cette étude, on a constaté une fréquence élevée du génotype 2a du GBV-C chez les patients lituaniens positifs au VHC. La présence du génotype 3 peut être corrélée à la situation géographique et à l'histoire de la Lituanie.