Journal des essais cliniques
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ISSN: 2167-0870
ISSN: 2167-0870
Zhang Zhengjun
La découverte de gènes biologiquement directement ou indirectement liés au cancer du poumon a suscité beaucoup d'attention, et de nombreux gènes directement liés au cancer du poumon ont été signalés. Cependant, il n'a pas été confirmé si ces gènes « clés » publiés sont vraiment essentiels à la formation du cancer du poumon, c'est-à-dire qu'ils peuvent l'être avec des informations utiles très limitées. Par conséquent, la recherche de gènes essentiels reste un problème difficile dans la recherche sur le cancer du poumon. En utilisant une méthode d'analyse factorielle linéaire concurrente récemment développée dans la détection de gènes exprimés de manière différentielle, nous faisons progresser l'étude de la détection de gènes critiques du cancer du poumon à un niveau uniformément informatif. Un ensemble de quatre gènes communs et leurs effets fonctionnels sont détectés comme étant exprimés de manière différentielle dans des échantillons tumoraux et non tumoraux avec une sensibilité de 100 % et une spécificité de 100 % dans une étude sur l'adénocarcinome pulmonaire (LUAD) et une étude sur les cancers du poumon à cellules squameuses (LUSC) (deux cohortes nord-américaines avec 20429 gènes, 576 et 552 échantillons respectivement). Deux analyses supplémentaires ont également permis d'obtenir une précision de 97,8 % de sensibilité et de 100 % de spécificité dans une étude sur les carcinomes pulmonaires non à petites cellules (NSCLC, une cohorte européenne avec 20 356 gènes et 156 échantillons), et une précision de 100 % de sensibilité et de 95 % de spécificité (1 sur 20 échantillons non tumoraux) dans une étude sur les adénocarcinomes pulmonaires ALK-positifs et EGFR/KRAS/ALK-négatifs (LUAD, une cohorte japonaise avec 20 356 gènes et 224 échantillons). Il existe des gènes communs, mais des effets fonctionnels différents, au sein de chaque ensemble de quatre gènes parmi deux cohortes nord-américaines et une cohorte européenne et entre les cohortes nord-américaines et la cohorte japonaise. Ces résultats montrent que les classificateurs basés sur quatre gènes sont robustes avec différents types de cancers du poumon et différentes cohortes raciales et précis. Les effets fonctionnels de quatre gènes révèlent de manière significative d'autres mécanismes (mystères) entre LUAD et LUSC. Ces quatre gènes et leurs effets fonctionnels sont considérés comme essentiels pour les études et la pratique sur le cancer du poumon. Les effets fonctionnels de ces gènes classent naturellement les patients en différents groupes (plus de sept sous-types). Les informations sur les sous-types sont utiles pour les thérapies personnalisées. Les nouvelles découvertes peuvent motiver de nouvelles recherches sur le cancer du poumon dans des directions plus ciblées pour sauver des vies, protéger les personnes et réduire les énormes coûts économiques de la recherche et des traitements contre le cancer du poumon.