ISSN: 1948-5964
Alessia Lai, Laura Milazzo, Annalisa Bergna, Maurizio Polano, Francesca Binda, Marco Franzetti, Valeria Micheli, Paola Ronzi, Gianguglielmo Zehender, Salvatore Sollima, Massimo Galli et Claudia Balotta
En raison de la grande variabilité du virus de l'hépatite C (VHC), il pourrait être important de caractériser in vivo l'évolution des mutations associées à la résistance (RAV) aux antiviraux à action directe (AAD) dans différents génotypes.
Les substitutions NS3, NS5A et NS5B du VHC ont été étudiées par séquençage de nouvelle génération (NGS) sur 74 patients infectés par le VHC qui ont commencé un traitement par AAD. Des RAV avec des fréquences de 1 % et 15 % ont été analysées.
Au niveau mondial, 43, 15, 12 et 4 patients étaient infectés respectivement par les sous-types 1a, 1b, le génotype 4 et le sous-type 3a. La majorité des patients (64,8 %) souffraient de cirrhose, 70,3 % étaient co-infectés par le VIH et 14,9 % avaient déjà pris des AAD. Français La prévalence globale de base des RAV était de 74,3 %, 52,2 %, 45,9 % et 36,8 % pour tous les inhibiteurs de NS3, NS5B et NS5A disponibles à ce moment-là, respectivement, et est tombée à 39,2 %, 26,1 %, 22,8 % et 16,2 %, respectivement, lorsque seules les mutations associées au régime en cours ont été prises en compte. La proportion la plus élevée de mutations a été détectée dans le sous-type 1a (81,4 %, p = 0,026), en particulier dans la région NS3 (76,9 %, p < 0,001). Parmi les 7 patients en échec, 57,1 % avaient une séquence de base montrant des substitutions comme espèces majoritaires. Au moment de la rechute virale, deux patients ont accumulé d'autres RAV qui manquaient même en tant que variants minoritaires au départ.
Bien que près de la moitié des patients aient montré des substitutions naturelles au départ, ces substitutions n'ont pas induit de résistance aux AAD. Notre étude suggère un rôle limité du NGS avec un seuil bas, car la détection d'espèces mineures ne semble pas prédire la sélection de variants résistants au moment de l'échec. L'impact des RAV pré-traitement sur l'obtention d'une réponse virologique soutenue avec DAA est limité.