ISSN: 2376-130X
Mohd. Murshad Ahmed, Safia Tazyeen, Aftab Alam, Anam Farooqui, Shahnawaz Ali, Md. Zubbair Malik et Romana Ishrat
La maladie rénale chronique (MRC) devient un problème de santé publique de grande ampleur dans le monde entier. L'anxiété actuelle face à la maladie pourrait être due au changement de la pathogénicité sous-jacente. Le but de notre étude était de fournir une analyse détaillée des données d'expression génétique des puces à ADN de la MRC en corrélation avec le diabète et l'identification des gènes biomarqueurs. Ici, les puces à ADN Affymetrix ont été utilisées pour identifier les gènes exprimés différemment dans 22 et 69 échantillons de MRC et de diabète respectivement. Il décrit en outre quelques-unes des principales altérations biologiques observées dans l'état de MRC et décrit des procédures spécifiques pour mener une évaluation de la qualité de la puce à ADN Affymetrix à l'aide d'ensembles de données GEO (GSE70528, GSE11045) et illustre également des packages de contrôle de la qualité pour remarquer la visualisation pour une analyse détaillée. Nous avons identifié 912 gènes exprimés différemment dans la MRC et 629 dans le diabète. À partir d'une comparaison approfondie de la MRC et du diabète, nous avons trouvé 80 gènes communs, dont 29 ont été trouvés régulés à la hausse et 51 à la baisse. De plus, l'analyse avec NCG de ces 80 gènes a révélé que 10 gènes communs impliqués dans divers types de cancer ont été identifiés. Ainsi, les résultats soulignent l'importance de ces 10 gènes communs différentiellement exprimés en les considérant comme des biomarqueurs pour trois maladies : le diabète, l'IRC et le cancer. Nos études ont répertorié des gènes différentiellement exprimés qui peuvent jouer un rôle important dans la pathogenèse de l'IRC et pourraient servir de biomarqueurs.