Journal des antiviraux et des antirétroviraux

Journal des antiviraux et des antirétroviraux
Libre accès

ISSN: 1948-5964

Abstrait

Des analyses in silico des souches du virus de l'hépatite B de génotype E provenant de patients centrafricains naïfs de traitement révèlent d'importantes mutations dans le génome complet

Giscard Wilfried Koyaweda, Rosaline Macharia, Juliette Rose Ongus, Eunice Machuka, Roger Pelle, Narcisse Patrice Komas*

Contexte : Le virus de l’hépatite B (VHB) reste un problème de santé publique sérieux malgré les mesures de prévention et de traitement actuellement mises en œuvre. Il existe peu de données sur la caractérisation moléculaire des souches circulant en République centrafricaine (RCA). Nous avons séquencé le génome complet du VHB isolé chez des patients centrafricains.

Méthodologie : Les échantillons de sérum ont été collectés à l'Institut Pasteur de Bangui. Le génome viral complet a été isolé et séquencé en utilisant la technique de Sanger avec quatre amorces chevauchantes. Les séquences ont été analysées in silico pour les mutations et la résistance aux médicaments en utilisant des outils bioinformatiques.

Résultats : Quatre génomes VHB complets ont été séquencés avec succès. Les quatre isolats appartenaient au génotype E et contenaient une mutation rtI90L dans le domaine fonctionnel A de la transcriptase inverse (RT). Un isolat comportait une mutation non-sens à l'extrémité 3' du S-ORF conduisant à un codon stop prématuré et à la production de séquences protéiques courtes pour les trois protéines de surface (antigènes de surface grands, moyens et petits). L'analyse in silico a montré que ce même isolat mutant portait également une mutation rtH234N dans le domaine fonctionnel D de la RT qui augmente l'énergie de liaison et conduit à des affinités réduites pour l'adéfovir et le ténofovir.

Conclusions : Le génotype E de l'hépatite B est le principal génotype circulant dans la région CAR. Nous avons identifié une mutation dans le gène RT d'une souche de VHB de la région CAR et cette mutation peut être associée à une résistance aux médicaments. Par conséquent, il est nécessaire de mener des recherches plus approfondies sur la RT du VHB dans les souches de VHB en circulation dans la région CAR.

Clause de non-responsabilité: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été révisé ou vérifié.
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