Rutvi Vaja, Harpreet Kaur, Mohit Mazumder, Elia Brodsky
La sclérose en plaques (SEP) est une maladie neurologique inflammatoire auto-immune chronique largement associée à la dégradation de la matière grise et blanche due à la démyélinisation des axones. Ainsi, l'exposition des causes sous-jacentes de cette condition peut conduire à une nouvelle approche thérapeutique pour la sclérose en plaques. Les données traitées par microarray d'ARN total de GEO pour les patients atteints de sclérose en plaques (SEP) ont été analysées de manière exhaustive pour découvrir les différences sous-jacentes entre les lésions de la matière grise (GML), la matière grise d'apparence normale (NAGM) et la matière grise de contrôle au niveau transcriptomique. Ainsi, dans l'étude actuelle, nous avons effectué diverses analyses bioinformatiques sur les profils transcriptionnels de 184 échantillons, dont 105 NAGM, 37 GML et 42 contrôles obtenus à partir du projet NCBI-Bio (PRJNA543111). Tout d'abord, une analyse exploratoire des données basée sur les données d'expression génétique à l'aide de l'analyse en composantes principales (ACP) a décrit des modèles distincts entre les échantillons GML et CG. Français Par la suite, l'analyse de l'expression différentielle des gènes par test T de Welch a identifié 1525 gènes significativement exprimés de manière différentielle (valeur p. adj < 0,05, changement de repli (>= +/- 1,5) entre ces conditions. Cette étude révèle que les gènes comme CREB3L2, KIF5B, WIPI1, EP300, NDUFA1, ATG101 et TAF4 sont les principales caractéristiques qui peuvent contribuer de manière substantielle à la perte des fonctions cognitives dans la sclérose en plaques et plusieurs autres troubles neurodégénératifs. De plus, cette étude propose également des gènes associés à la maladie de Huntington chez les patients atteints de sclérose en plaques. Finalement, les résultats présentés ici révèlent de nouvelles perspectives sur la SEP et sur la façon dont elle affecte le développement des caractères sexuels primaires masculins.