Techniques avancées en biologie et médecine
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Abstrait

Les techniques de récupération d’antigènes améliorent-elles le rendement en ADN des tissus fixés au formol et inclus dans la paraffine ?

Subash Govender et Richard Naidoo

Cette étude a examiné l'utilisation de la cuisson sous pression avec différentes solutions de récupération à des pH variables pour déterminer le protocole optimal pour l'extraction d'ADN de haute qualité à partir de tissus fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE). De plus, l'effet de l'oxydation sur les tissus FFPE archivés par rapport à l'âge des blocs de tissus a également été exploré. L'objectif principal de l'étude était d'étudier cette technique sur 11 cancers gastriques. La conception de notre étude était basée sur les principes de la technique de récupération d'antigènes à l'aide d'un autocuiseur conventionnel pour améliorer la qualité de l'ADN extrait des tissus FFPE. En plus des cancers gastriques, des lymphomes, des carcinomes du sein, de la prostate et colorectaux ont été utilisés pour éliminer les biais tissulaires. La corrélation statistique a été réalisée à l'aide du test t apparié et du test de Benjamini-Hochberg. Nos résultats montrent que des concentrations élevées d'ADN ont été obtenues en utilisant les différentes solutions de récupération avec cuisson sous pression, par rapport aux échantillons témoins qui n'ont pas été soumis à cette procédure. La concentration moyenne d'ADN a augmenté avec toutes les solutions testées, mais le rendement d'ADN était significativement plus élevé dans 3 des 4 solutions de récupération utilisées. L'utilisation de solutions de récupération d'antigènes à haute pression et à haute température fournies par la cuisson sous pression peut permettre d'inverser l'effet de réticulation du formol dans les tissus FFPE. De plus, l'observation selon laquelle l'ADN extrait de blocs récemment traités avait un rendement supérieur à celui des blocs de tissus plus anciens, confirme que l'oxydation a un effet de détérioration sur l'ADN.