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Abstrait

Analyse différentielle de l'ADNc impliqué dans les tapis microbiens

Rajarshi Patnaik

Des tapis microbiens intacts provenant de marais salants de Camargue (France) conservés en microcosme ont été souillés par du fioul Erika afin de reconnaître les arrangements de qualité déclenchés en conséquence d'une pollution importante par le fioul. L'approche de l'exposition différentielle a été ajustée pour reconnaître l'ARNm communiqué différemment dans des réseaux bactériens complexes. Parmi les six fragments d'ADNc communiqués différemment (DD) extraits, l'un a été distingué et connecté à un siphon d'efflux de type ABC. Un fragment DD ultérieur a été identifié avec une protéine spéculative modérée trouvée dans une large gamme d'espèces bactériennes. Bien que les fragments communiqués différemment se soient avérés impossibles à identifier clairement, cette étude révèle de nouvelles perspectives pour l'amélioration de notre compréhension de la réaction du réseau microbien après contamination par le pétrole. Les microbes sont considérés comme les principaux acteurs biotiques à l'écran dans la corruption des produits à base de pétrole dans la nature. Comme une seule espèce bactérienne peut corrompre un nombre limité d'hydrocarbures, la biodégradation in situ du pétrole est normalement effectuée par un consortium composé de nombreuses espèces bactériennes. Différentes variables peuvent avoir un impact sur la solidité de la structure du réseau bactérien qui intègre la rivalité bactérienne, les prophages et les conditions physiques/de préparation. Dans les zones côtières, particulièrement exposées aux déversements accidentels de pétrole et à d'autres pratiques inappropriées, des tapis microbiens se forment à l'interface eau-lies. L'accomplissement naturel de ces structures bactériennes et leur vaste groupe d'activités microbiennes suggèrent qu'elles peuvent être utiles pour la biorestauration des contaminations écologiques.