Journal de chimie physique et biophysique
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Abstrait

Structure cristalline de GroEL d'Escherichia coli dans le substrat et à l'état déchargé d'ADP

Sitaram Meena et Ajay K Saxena

E. coli GroEL est un membre de la famille des chaperonines dépendantes de l'ATP et est impliqué dans le repliement correct des protéines bactériennes cytosoliques. E. coli GroEL contient 14 sous-unités identiques d'environ 58,3 kD et disposées en deux anneaux pédonculés. Dans l'étude actuelle, nous avons déterminé la structure aux rayons X d'E. coli GroEL à une résolution de 3,2 Å. La protéine GroEL a été coexprimée pendant l'expression de la protéine recombinante DprE1 de M. tuberculosis dans E. coli et a été co-purifiée avec DprE1. Le complexe GroEL-DprE1 a été cristallisé et l'analyse de la structure aux rayons X a donné une densité électronique uniquement pour la protéine GroEL et aucune densité pour la protéine DrpE1. La comparaison de notre structure GroEL avec les structures précédentes de type sauvage GroEL (PDB-1XCK), DM-GroEL-(ATP)14 (PDB-1KP8) et GroEL-GroES-(ADP)7 (PDB-1PF9) a révélé les différences dans (i) les interactions entre les anneaux heptamériques impliqués dans la signalisation allostérique (ii) les interactions au sein de l'anneau heptamérique, (iii) les hélices H et I du domaine apical impliquées dans la liaison du substrat et (iv) les résidus impliqués dans la voie de signalisation. Ces résultats indiquent que notre structure GroEL peut être dans un état différent, qui s'est produit pendant le cycle de repliement des protéines après le déchargement du substrat et de l'ADP.