Immunogénétique : Libre accès

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Abstrait

Construction du score de pronostic lié au système immunitaire pour prédire le bénéfice de l'immunothérapie dans le cancer colorectal

Jun Xiang1#, JunHu Li2#, XiaoNan Cheng3, HanQing Hu1, Lei Yu1*, GuiYu Wang1*

Contexte : Depuis que la Food and Drug Administration (FDA) a approuvé les inhibiteurs de points de contrôle immunitaires pour le traitement du cancer colorectal en 2017, des différences significatives ont été observées dans la réponse des patients atteints de cancer colorectal aux inhibiteurs de points de contrôle immunitaires. Afin d'obtenir de meilleurs bénéfices cliniques pour les patients atteints de cancer colorectal en immunothérapie, nous devons de toute urgence trouver un biomarqueur pour évaluer si les patients atteints de cancer colorectal répondent à l'immunothérapie. Dans cette recherche, nous avons cherché à explorer un biomarqueur pour prédire l'efficacité de l'immunothérapie pour les patients atteints de cancer colorectal.

Matériel et méthodes : Nous avons collecté les profils d'expression et les informations cliniques de plus de 1800 patients atteints de cancer colorectal dans 6 cohortes dans les bases de données Gene Expression Omnibus (GEO) et The Cancer Genome Atlas (TCGA) et, dans le même temps, nous avons collecté 230 signatures liées au système immunitaire en effectuant des recherches dans la littérature. Une analyse d'enrichissement d'un ensemble de gènes à échantillon unique a été réalisée sur 230 signatures, et le score d'enrichissement normalisé de chaque patient a été calculé. Ensuite, le score de pronostic lié au système immunitaire (IRPS) a été construit sur la base des scores d'enrichissement normalisés. Enfin, une analyse approfondie a été réalisée pour explorer la relation entre l'IRPS et le score immunitaire, la signification pronostique, le statut des microsatellites, les facteurs immunogénomiques, le génotype du cancer et le mécanisme potentiel d'échappement immunitaire.

Résultats : Nous avons constaté que l'IRPS peut refléter l'état d'infiltration immunitaire des patients atteints de cancer colorectal et qu'il est lié à certains facteurs immunophénotypiques importants, tels que la charge néoantigène et la charge mutationnelle tumorale (TMB). Une analyse plus approfondie a confirmé que les patients avec un faible IRPS avaient une meilleure réponse aux inhibiteurs du point de contrôle immunitaire.

Conclusion : Sur la base de ces résultats, nous pouvons conclure que l’IRPS peut être un outil disponible pour la prédiction de l’efficacité de l’immunothérapie chez les patients atteints de cancer colorectal.

Clause de non-responsabilité: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été révisé ou vérifié.
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