Jiankang Zhao*, Yulin Zhang, Bin Cao3
Contexte : À ce jour, plusieurs kits de détection d'acide nucléique du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) sont disponibles en Chine. Le virus pourrait avoir une faible charge dans les échantillons, ce qui entraînerait des résultats faussement négatifs et un sous-diagnostic. Il est donc urgent d'évaluer la sensibilité de ces kits couramment utilisés.
Méthodes : Six kits de PCR en temps réel (RT-PCR) pour le SARS-CoV-2 fabriqués en Chine ont été évalués, à savoir BGI, Sansure, DaAn, BioGerm, GeneoDx et Liferiver. Nous avons utilisé 4 dilutions en série (10 fois) de 7 échantillons inactivés pour le test, prélevés auprès de patients atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). De plus, le nombre de tests positifs, les valeurs de limite de détection (LoD) et de seuil de cycle (CT) ont été utilisés pour analyser leurs sensibilités.
Résultats : Pour les 7 échantillons à la concentration d'origine, les échantillons 1 à 5 avec une dilution de 10 -1 et l'échantillon 1 avec une dilution de 10 -2 , les 6 kits étaient positifs. La sensibilité des kits variait en fonction de la diminution de la concentration en acide nucléique. Parmi les 28 échantillons, le kit BGI a obtenu 26 tests positifs, suivi respectivement de Sansure, DaAn, BioGerm, GeneoDx et Liferiver. De plus, la LoD du kit BGI était la plus basse. La comparaison par paires des valeurs Ct moyennes des 6 kits ci-dessus a révélé que BGI avait les valeurs CT les plus significativement plus basses pour le gène ORF 1ab, tandis que Sansure avait de meilleures performances pour la détection du gène N.
Conclusions : Les 6 kits peuvent fournir des résultats de détection précis dans les échantillons cliniques présentant des charges virales élevées. Le kit BGI était le plus sensible. Chaque kit avait ses propres avantages et inconvénients, et une optimisation supplémentaire est nécessaire.